Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms