Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms