Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms