Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3336J3QMQ6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms