Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6594J3QM43 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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