Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmem200cJ3QK46 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmem200cJ3QK46 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmem200cJ3QK46 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tmem200cJ3QK46 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tmem200cJ3QK46 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tmem200cJ3QK46 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tmem200cJ3QK46 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem200cJ3QK46 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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