Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp408H7BX78 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms