Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms