Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms