Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Usp9yF8VPU6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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