Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms