Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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