Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms