Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

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Length 4,418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hectd4E9Q2E4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hectd4E9Q2E4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms