Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms