Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms