Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms