Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm17333C6EQI3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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