Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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