Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms