Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AU015836B2RUM3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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AU015836B2RUM3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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AU015836B2RUM3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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AU015836B2RUM3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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AU015836B2RUM3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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AU015836B2RUM3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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AU015836B2RUM3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AU015836B2RUM3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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