Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PtprbB2RU80 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PtprbB2RU80 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PtprbB2RU80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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