Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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