Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms