Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms