Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms