Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms