Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Speer3W4VSP1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms