Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hdac6Q9Z2V5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hdac6Q9Z2V5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac6Q9Z2V5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Hdac6Q9Z2V5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hdac6Q9Z2V5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hdac6Q9Z2V5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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