Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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