Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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