Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh11Q9QYF1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rdh11Q9QYF1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rdh11Q9QYF1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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