Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms