Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms