Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms