Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Rabgef1Q9JM13 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Rabgef1Q9JM13 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Rabgef1Q9JM13 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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