Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
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