Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Tmod4Q9JLH8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod4Q9JLH8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmod4Q9JLH8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmod4Q9JLH8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmod4Q9JLH8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmod4Q9JLH8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmod4Q9JLH8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmod4Q9JLH8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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