Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tgm1Q9JLF6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tgm1Q9JLF6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tgm1Q9JLF6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tgm1Q9JLF6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tgm1Q9JLF6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tgm1Q9JLF6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tgm1Q9JLF6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tgm1Q9JLF6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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