Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms