Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp6Q9ESX2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sp6Q9ESX2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sp6Q9ESX2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sp6Q9ESX2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sp6Q9ESX2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sp6Q9ESX2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sp6Q9ESX2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sp6Q9ESX2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp6Q9ESX2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms