Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms