Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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