Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp12Q9D9M2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp12Q9D9M2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp12Q9D9M2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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