Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf3c6Q9D8P7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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