Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms