Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms