Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms