Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9D7E4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms