Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Srp19Q9D7A6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms